| 43巻 | ||
| 461話 | VS ポカブ | 前夜 |
| 462話 | VS クルミル | 旅立 |
| 463話 | VS コロモリ | 追憶 |
| 464話 | VS モンメン | 初戦 |
| 44巻 | ||
| 465話 | VS デンチュラ | 入社 |
| 466話 | VS ドッコラー | 演説 |
| 467話 | VS チョロネコ | 解放 |
| 468話 | VS オタマロ | 戴冠 |
| 469話 | VS タブンネ | 接客 |
| 470話 | VS ヤナップ・バオップ・ヒヤップ | 協力 |
| 471話 | VS ミルホッグ | 研究 |
| 45巻 | ||
| 472話 | VS ズルッグ | 企画 |
| 473話 | VS ミネズミ | 書庫 |
| 474話 | VS ムーランド | 起源 |
| 475話 | VS デスカーン | 竜骨 |
| 476話 | VS ヤブクロン・チラチーノ | 疾風 |
| 477話 | VS ゾロア | 迷子 |
| 478話 | VS ハハコモリ | 芸術 |
| 479話 | VS モロバレル | 進化 |
| 46巻 | ||
| 480話 | VS ビクティニ | 灯台 |
| 481話 | VS キリキザン | 砂漠 |
| 482話 | VS マラカッチ | 準備 |
| 483話 | VS エモンガ | 開演 |
| 484話 | VS ゼブライカ | 回転 |
| 485話 | VS ジャノビー | 数式 |
| 486話 | VS ナゲキ・ダゲキ | 鉄道 |
| 487話 | VS コジョンド | 決意 |
| 488話 | VS シキジカ | 別離 |
| 47巻 | ||
| 489話 | VS ガマガル | 跳橋 |
| 490話 | VS トルネロス・ボルトロス | 風雷 |
| 491話 | VS バニプッチ | 冷凍 |
| 492話 | VS ドリュウズ | 出土 |
| 493話 | VS ワルビル | 感知 |
| 494話 | VS ココロモリ | 集合 |
| 495話 | VS スワンナ | 参戦 |
| 48巻 | ||
| 496話 | VS トルネロス・ボルトロス・ランドロスⅠ | 激突 |
| 497話 | VS トルネロス・ボルトロス・ランドロスⅡ | 復活 |
| 498話 | VS フリージオ | 修行 |
| 499話 | VS プロトーガ | 暴走 |
| 500話 | VS メロエッタⅠ | 旋律 |
| 501話 | VS メロエッタⅡ | 演奏 |
| 502話 | VS ワシボン | 邂逅 |
| 503話 | VS ムンナ | 仲間 |
| 49巻 | ||
| 504話 | VS バニリッチ | 気配 |
| 505話 | VS ツンベアー | 条件 |
| 506話 | VS コバルオン・テラキオン・ビリジオンⅠ | 三剣 |
| 507話 | VS コバルオン・テラキオン・ビリジオンⅡ | 信用 |
| 508話 | VS ヒヒダルマ | 頂上 |
| 509話 | VS アーケオス | 超越 |
| 510話 | VS ダイケンキ | 必要 |
| 50巻 | ||
| 511話 | VS ゴチルゼル | 開幕 |
| 512話 | VS クリムガン | 交信 |
| 513話 | VS グレッグル | 潜入 |
| 514話 | VS モノズ | 熱闘 |
| 515話 | VS ケルディオ | 清心 |
| 516話 | VS オノンド | 四強 |
| 517話 | VS オーベム | 鳴動 |
| 518話 | VS ケンホロウ | 親友 |
| 51巻 | ||
| 519話 | VS ケルディオⅡ | 狩人 |
| 520話 | ゼクロムVSレシラムⅠ | 居城 |
| 521話 | ゼクロムVSレシラムⅡ | 真実 |
| 522話 | ゼクロムVSレシラムⅢ | 理想 |
| 523話 | ゼクロムVSレシラムⅣ | 英雄 |
| 524話 | ゼクロムVSレシラムⅤ | 消失 |
| 52巻 | ||
| 525話 | VS ペンドラー | トランスファー・スチューデント |
| 526話 | VS ゲノセクトⅠ | ミスター・パーフェクト |
| 527話 | VS ゲノセクトⅡ | フライング・インセクト |
| 528話 | VS ゲノセクトⅢ | イノセント・サイエンティスト |
| 529話 | VS タマゲタケ | ポケデクス・レクチャー |
| 530話 | VS バルチャイ | ムービーズ・パニック |
| 531話 | VS プルリル | アンフォゲッタブル・メモリー |
| 53巻 | ||
| 532話 | VS トルネロス れいじゅうフォルムⅠ | レジェンダリー・トルネード |
| 533話 | VS トルネロス れいじゅうフォルムⅡ | ニュー・ソードプレイヤー |
| 534話 | VS シキジカ | コーラス・コンペティション |
| 535話 | VS オーベム | アングリー・ボーイ |
| 536話 | VS キュレムⅠ | コンテナ・バトル |
| 537話 | VS キュレムⅡ | アクロマ・マシーン |
| 538話 | VS ボルトロス れいじゅうフォルムⅠ | テリアン・フォーム |
| 539話 | VS ランドロス れいじゅうフォルムⅡ | フローズン・ワールド |
| 540話 | VS バルジーナ | フライング・シップ |
| 54巻 | ||
| 541話 | VS メラルバ | ピンク・スリップ |
| 542話 | VS ママンボウ | エヌ・リターンズ |
| 543話 | VS チョボマキ | アビシャル・リューインズ |
| 544話 | VS ブラックキュレム | ドリーム・ワールド |
| 545話 | VS ギギアル | リーズニング・タイム |
| 546話 | VS ホワイトキュレム | ジャイアント・ホール |
| 55巻 | ||
| 547話 | 最終決戦 | クラッシュド・アンビション |
| 548話 | エピローグ | グラジュエーション・セレモニー |