| 30巻 | ||
| 338話 | VS ムックル | パールとダイヤ |
| 339話 | VS ビッパ | ビッパとお嬢様 |
| 340話 | VS ルクシオ | ツッコミとリズム |
| 341話 | VS コロボーシ | ポッチャマとプライド |
| 342話 | VS ズガイドス | ヒョウタとクロガネジム |
| 343話 | VS ミツハニー | 花畑と甘い蜜 |
| 344話 | VS ドーミラー | 発電所と砂嵐 |
| 345話 | VS ロトム | 森と洋館 |
| 346話 | VS ロズレイドⅠ | 特訓と初進化 |
| 31巻 | ||
| 347話 | VS ロズレイドⅡ | ロズレイドと毒のトゲ |
| 348話 | VS スカンプー | 自転車とスカンプー |
| 349話 | VS ダイノーズ・ジバコイル | シンオウ地方とテンガン山 |
| 350話 | VS ミミロル | お嬢様とコンテスト |
| 351話 | VS パチリス | 会長と三人組 |
| 352話 | VS グレッグル・ケーシィⅠ | メリッサとロストタワー |
| 353話 | VS グレッグル・ケーシィⅡ | パカとウージ |
| 354話 | VS アンノーンⅠ | 新聞社と謎の文字 |
| 355話 | VS アンノーンⅡ | アンノーンと古代遺跡 |
| 32巻 | ||
| 356話 | VS アサナン・リオルⅠ | スロットとスモモ |
| 357話 | VS アサナン・リオルⅡ | ジム戦とゲームコーナー |
| 358話 | VS ムクバード・スカタンクⅠ | 令嬢とボディーガード |
| 359話 | VS ムクバード・スカタンクⅡ | 敵と味方 |
| 360話 | VS フカマル | 終わりと始まり |
| 361話 | VS ビーダル・ヒポポタス | 雨と足跡 |
| 362話 | VS ドラピオン・コロトックⅠ | 光と記憶 |
| 363話 | VS ドラピオン・コロトックⅡ | 湖と影 |
| 364話 | VS スコルピ | 大湿原とサファリゲーム |
| 33巻 | ||
| 365話 | VS マスキッパ | マキシとノモセシティ |
| 366話 | VS フローゼル | 勝利とファイトマネー |
| 367話 | VS コダック | コダックと秘伝の薬 |
| 368話 | VS ジバコイル・ダイノーズⅠ | カンナギと長老 |
| 369話 | VS ジバコイル・ダイノーズⅡ | 壁画と襲撃者 |
| 370話 | VS ジバコイル・ダイノーズⅢ | 意志と感情 |
| 371話 | VS フワライド | 学会と誘拐 |
| 372話 | VS ムウマージⅠ | ヨスガジムと計算問題 |
| 373話 | VS ムウマージⅡ | 幻覚と現実 |
| 374話 | VS ドータクンⅠ | 娘と父 |
| 34巻 | ||
| 375話 | VS ドータクンⅡ | 真実と偽り |
| 376話 | VS ムクホーク | 決意と告白 |
| 377話 | VS ギャロップ | 別れと旅立ち |
| 378話 | VS グライオン | シンオウ丸と船出 |
| 379話 | VS ルカリオⅠ | ゲンとこうてつ島 |
| 380話 | VS ルカリオⅡ | 洞窟と卒業課題 |
| 381話 | VS ビークイン・ガーメイルⅠ | すばやさと〝はっぱカッター〟 |
| 382話 | VS ビークイン・ガーメイルⅡ | 悪意と波動 |
| 383話 | VS キャモメ | 製鉄所と発注書 |
| 384話 | VS ブビィ | タタラと動く床 |
| 35巻 | ||
| 385話 | VS ヘルガー | 矢印と透視力 |
| 386話 | VS ゴローン | 雪山とジムリーダー |
| 387話 | VS ユキカブリ | キッサキとスズナ |
| 388話 | VS ユキメノコ | 新顔と勝利 |
| 389話 | VS ピッピ | 宇宙とＧマーク |
| 390話 | VS ベロリンガ | ポケッチとキャンペーン |
| 391話 | VS ベロベルト | ベロベルトと宝物 |
| 392話 | VS ウツドン | 豪邸と執事 |
| 393話 | VS メガヤンマⅠ | 研究所とハマナ |
| 394話 | VS メガヤンマⅡ | 羽音と衝撃波 |
| 36巻 | ||
| 395話 | VS ヤミラミ | エイチ湖とジュピター |
| 396話 | VS トリトドン | 強敵と三人娘 |
| 397話 | VS オクタン | 爆弾とカウントダウン |
| 398話 | VS モジャンボ | 三匹と見えないつながり |
| 399話 | VS カイリキー | 激闘と敗北 |
| 400話 | VS ヌオー | 大雨と助け手 |
| 401話 | VS ブイゼルⅠ | 捕獲と弟子入り |
| 402話 | VS ブイゼルⅡ | アカギと完全な世界 |
| 403話 | VS ベトベター | パールと新チーム |
| 404話 | VS エレキッド | 敵陣と侵入者 |
| 37巻 | ||
| 405話 | VS エレキブル | 強さと体験 |
| 406話 | VS ドンガラス | のんきとせっかち |
| 407話 | VS リーシャン | 変装と潜入 |
| 408話 | VS ゴースト | 図鑑と朝の音 |
| 409話 | VS ミカルゲ | チャンピオンとBOSS |
| 410話 | VS ユレイドル | 3匹と解放 |
| 411話 | VS ディアルガ・パルキアⅠ | 運命とやりの柱 |
| 412話 | VS ディアルガ・パルキアⅡ | 時間と空間 |
| 38巻 | ||
| 413話 | VS ディアルガ・パルキアⅢ | 〝ときのほうこう〟と〝あくうせつだん〟 |
| 414話 | VS ディアルガ・パルキアⅣ | SHITAPPAと個体意志 |
| 415話 | VS ディアルガ・パルキアⅤ | 完全と不完全 |
| 416話 | VS ディアルガ・パルキアⅥ | ダイヤとパール |
| 417話 | VS ミミロップ | リゾートエリアの待ち合わせ |
| 418話 | VS ポリゴンZ | ポイントのやりくり |
| 419話 | VS エルレイドⅠ | キャッスルのブレーン |
| 420話 | VS エルレイドⅡ | 執事の油断 |
| 421話 | VS ネンドール | 勝負処のバク |
| 422話 | VS フシギソウ | ハードマウンテンのお宝 |
| 39巻 | ||
| 423話 | VS トゲキッス | 取り換えっこのパネル |
| 424話 | VS エンペルト | 目覚めの一歩 |
| 425話 | VS ヒードラン | 野望のプルート |
| 426話 | VS コクーン | レンタルの施設 |
| 427話 | VS タネボー | 妨害の電波 |
| 428話 | VS レディアン | クロツグの頼み事 |
| 429話 | VS カイリュー | 激闘のステージ |
| 430話 | VS ロトム（ヒート・ウォッシュ・カット・スピン・フロスト） | 五つの家電品 |
| 40巻 | ||
| 431話 | 異次元決戦Ⅰ | 叛骨のギラティナ |
| 432話 | 異次元決戦Ⅱ | 戦士たちの出陣 |
| 433話 | 異次元決戦Ⅲ | 影の一撃 |
| 434話 | 異次元決戦Ⅳ | 怒りのフォルムチェンジ |
| 435話 | 異次元決戦Ⅴ | 偵察機の主 |
| 436話 | 異次元決戦Ⅵ | 集団戦の始まり |
| 437話 | 異次元決戦Ⅶ | 反物質の世界 |
| 438話 | 異次元決戦Ⅷ | 心のありよう |
| 439話 | 異次元決戦Ⅸ | 正義のウイルス |
| 440話 | 異次元決戦Ⅹ | オーキドの手紙 |
| 441話 | 異次元決戦ⅩⅠ | 魂の光 |
| 41巻 | ||
| 442話 | VS ナゾノクサ | 挑戦 ポケスロン！ |
| 443話 | VS エイパム | 四天王登場！ |
| 444話 | VS トゲピー | 極秘指令！ |
| 445話 | VS ドガース | 復活の狼煙！ |
| 446話 | VS マニューラ | サファリゾーンの戦い！ |
| 447話 | VS オーダイル | プレート争奪戦！ |
| 448話 | VS パラセクト | 噂の千里眼！ |
| 42巻 | ||
| 449話 | VS ドサイドン | 大地の継承！ |
| 450話 | VS エビワラー | 集合4将軍！ |
| 451話 | VS ネイティオ | 遺跡へのルート！ |
| 452話 | VS アルセウスⅠ | 伝達のサイン！ |
| 453話 | VS アルセウスⅡ | 語られる起源！ |
| 454話 | VS アルセウスⅢ | 突入 謎の領域！ |
| 455話 | VS アルセウスⅣ | 幻のタイプシフト！ |
| 456話 | VS アルセウスⅤ | 絶望の三つ舞台！ |
| 43巻 | ||
| 457話 | VS アルセウスⅥ | 「はざま」からの帰還！ |
| 458話 | VS アルセウスⅦ | いちるの望み！ |
| 459話 | VS アルセウスⅧ | 希望の最終進化！ |
| 460話 | VS アルセウスⅨ | 特別な明日！ |